Amandelstenen bestaan ​​uit bacteriën, voedselresten en dode cellen die zich ophopen in de spleten van de amandelen. De bacteriën breken het eiwit in de stenen af, waardoor vluchtige zwavelverbindingen vrijkomen die een vieze geur produceren. Deze geur is vergelijkbaar met die van rotte eieren of afval en kan behoorlijk onaangenaam zijn. Bovendien kunnen amandelstenen een reeks andere bacteriesoorten herbergen, waarvan sommige metabolische afvalproducten produceren die verder bijdragen aan de slechte geur. Slechte mondhygiëne, roken en bepaalde medische aandoeningen kunnen het risico op het ontwikkelen van amandelstenen vergroten en de bijbehorende geur verergeren.