Genotypering Gereedschap

Genetische onderzoekers gezamenlijke inspanningen om de gehele genetische sequentie , 9 miljard basen , in het menselijk genoom bepaald . Het genoom het DNA-gehalte in elke menselijke cel bestaat uit herhalende stikstofbasen aangeduid als " A ", " G ", " C " en " T" Genetisch onderzoek blijft zoeken naar variatie in verschillende menselijke genomen evenals verschillende soorten evolutionaire studies. Medische genetische studies zijn geïnteresseerd in het vinden van genetische afwijkingen of genetische variatie die ziekte kunnen veroorzaken . Genotypering is een werkwijze voor het bepalen van genetische variatie zonder sequencen een volledig genoom . Onderzoekers isoleren kleine gebieden van een genoom te zoeken naar verschillen in grootte , met een verschillend aantal stikstofbasen . Verschillende basegetal kan worden veroorzaakt door een genetische afwijking die leidt tot ziekten zoals diabetes , ziekte van Alzheimer en kanker . De instrumenten die worden gebruikt voor genotypering toepassingen uit te voeren zijn geëvolueerd en ontwikkeld om snel en nauwkeurig te bepalen individuele genotype . De polymerasekettingreactie

De evolutie van gentechnologie afkomstig van ontwikkeling van de polymerasekettingreactie of PCR . Deze methode maakt het onderzoekers te versterken of kopieën van kleine gebieden van een genoom binnen enkele uren. De regio van belang wordt bepaald door de toevoeging van korte DNA-moleculen --- primers die overeenkomen met het begin en einde van de regio van belang . Heeft

PCR uitgegroeid tot een onmisbaar instrument in het genetisch onderzoek . Versterken dezelfde regio van verschillende individuen in een werkwijze voor vergelijking. Forensics identificatie gebruikt momenteel 15 verschillende regio's te vergelijken . Een regio kan evenaren in verschillende mensen . Er dient echter geen twee mensen overeenkomen met alle 15 regio's .
Agarosegelelectroforese

PCR is de methode voor het versterken van bepaalde gebieden van het DNA . Dit betekent echter geen methode om de werkelijke omvang van de fragmenten te vergelijken . Producten van PCR worden op grootte via een gelachtig materiaal genaamd " agarose . " Kleinere fragmenten migreren sneller over agarose in reactie op een elektrische stroom in een proces genaamd " agarosegelelektroforese . "

Na PCR -fragmenten worden geladen op de agarose en migreren langs de gel als er een elektrische stroom wordt toegepast . Ethidium bromide kan fragmenten zichtbaar wanneer onder ultraviolet licht . Agarosegelelektroforese een werkwijze voor het snel bepalen van succesvolle PCR en benadert fragmentgrootte . Het nadeel van agarose als een hulpmiddel voor genotypering is dat fragmenten wezenlijk verschillend in grootte moet worden voor nauwkeurige resultaten . Agarose biedt geen goed medium voor het vergelijken van verschillende fragmenten van een enkele base .
Geautomatiseerde sequencers en Genetic Analyzers
Fluorescent gelabelde DNA-fragmenten opgenomen door een geautomatiseerde sequencer .

Geautomatiseerde sequencers en genetische analysers zijn uitgegroeid tot de belangrijkste instrument dat wordt gebruikt in genotypering . Hiermee kunnen fragmenten , verschillende door een stikstofhoudende base , snel en goedkoop worden bepaald . Zoals met agarosegelelektroforese worden DNA -fragmenten eerst geamplificeerd door PCR . Echter , is een primer gelabeld met een fluorescerende kleurstof toevoegen van kleur aan het fragment . Monsters worden op grootte gescheiden door migrerende via een gelachtig polymeer in reactie op een elektrische stroom . Kleinere fragmenten gaan sneller dan grotere fragmenten . Aangezien de fragmenten migreren naar het uiteinde van het polymeer , een digitale camera registreert de kleur en stuurt de gegevens naar een computer voor analyse . Geautomatiseerde sequencing apparatuur wordt momenteel gebruikt in de forensische identificatie en vaderschap testen .
Next Generation sequencer ook Bepaal Genotypen

Next generation sequencing instrumenten zijn snel bleek tijdens de sinds 2006 . Deze techniek combineert PCR amplificatie en sequencing samen om miljoenen basen tegelijk . Het proces begint met PCR ; worden echter verschillende primers gebonden aan korrels gemengd in een reactie die duizenden gebieden te amplificeren tegelijk .

volgende generatie sequencers vervolgens de fragmenten gescheiden op grootte en maken een veelheid van DNA 's te analyseren . De methode is nadelig als een genotypering hulpmiddel wanneer onderzoekers zijn geïnteresseerd in het vergelijken van een enkel gebied van het genoom . Het voordeel is dat het genoom geïsoleerd uit een cel levert voldoende materiaal voor PCR amplificatie . Het vergelijken van de genotypen van normale en abnormale cellen geïsoleerd uit een enkel individu kan helpen bij het identificeren kankercellen en mogelijke behandelingen .