Protocollen Gebruikt in KSAR

QSAR staat voor kwantitatieve structuur -activiteit relatie. Om aan te tonen hoe een chemische structuur kwantitatief kan worden gecorreleerd aan een specifieke werkwijze wordt QSAR vaak gebruikt voor het ontwerpen van geneesmiddelen en drugs . Deze methode wordt gebruikt om de chemische synthese te leiden , omdat er vele duizenden verschillende mogelijke structuren voor een molecuul en wetenschappers anders zou verspillen veel tijd testen elke structuur . Statistieken een belangrijke rol spelen in de methodologie van QSAR . Multipele Lineaire Regressie

Multiple lineaire regressie-analyse wordt gebruikt wanneer er meerdere studies gebruikt die gerelateerd zijn aan een specifieke chemische structuur . Een vergelijking wordt ontwikkeld die , bijvoorbeeld , kan een relatie tussen tumorgrootte verminderen en de aanwezigheid van een hydrofobe groep op de vierde positie van een fenylring tonen . Deze analyse vermindert veel verschillende verbindingen , zodat het verband kan worden geïnterpreteerd met behulp van slechts een paar parameters die de belangrijkste zijn .
Pattern Recognition

patroonherkenning wordt gebruikt om de parameters te definiëren dat resultaat wanneer specifieke chemische structuren elkaar staan ​​. Er zijn verschillende soorten van patroonherkenning analyse, die hoofdcomponent Analyse , computer geautomatiseerde structuur evaluatie en geautomatiseerde data-analyse door patroonherkenning technieken omvatten . Statistieken patroonherkenning gebruiken oorspronkelijke gegevens en zullen de verschillende structuren correleren met de biologische resultaten op basis van verschillende dimensies , met de belangrijkste wezen in de eerste berekende component .
Vergelijkende Moleculaire veldanalyse

Deze versie van QSAR neemt partiële kleinste kwadraten analyse gecombineerd met cross validatie voorspellingen voor de biologische activiteit te creëren . In dit type van methodologie , zal de wetenschapper specifieke regels voor aanpassing van de moleculaire structuur toewijzen . Elk van de moleculen passen in een raster en verschillende interacties berekend op basis van interactie van een probe atoom tot verschillende rasters . Er zijn veel verschillende vergelijkingen die kan leiden . In tegenstelling tot andere type regressie Dit produceert vergelijkingen waarin er veel meer parameters dan mogelijke verbindingen
Apex - . 3D

Apex - 3D gebruikt een systeem die automatisch de beste uitlijning en bevestiging van de structuren op basis van de benodigde biologische respons uit eerdere experimenten . Het is mogelijk om het effect van verschillende bindende oriëntatie antagonistische activiteit versus agonistische activiteit en effect van de verschillende receptoren onthullen . Dit genereert 2D-en 3D- topografische matrices en kan informatie te genereren voor paren van moleculen in plaats van enkele moleculen.
Genetic Functie Harmonisatie

Genetische functie benadering wordt gebruikt wanneer er weinig monsters en verschillende variabelen onderzocht , en wanneer de datasets niet lineaire relaties . Deze maakt gebruik van best gewaardeerde modellen en slechtst gewaardeerde modellen berekend op basis van de ruwe data . Het bouwt een betere en betere kwaliteit modellen door het vervangen van de slechtst gewaardeerde modellen. De vele verschillende meerdere fits worden vervolgens verstrekt aan de wetenschapper , die vervolgens de uiteindelijke model . De overeenkomsten tussen de modellen worden bestudeerd om informatie te verstrekken over de structurele en biologische correlaties .