De ziekten die de overblijfselen van het Incarijk teisterden na contact met de Spaanse veroveraars in de 16e eeuw omvatten pokken, mazelen, griep, tyfus en gele koorts. Deze ziekten waren verwoestend voor de inheemse bevolking omdat ze vrijwel niet eerder aan deze ziekten waren blootgesteld en daarom weinig natuurlijke immuniteit hadden.
