Protocollen gebruikt in KSAR

QSAR staat voor kwantitatieve structuur-activiteit relatie. Om aan te tonen hoe een chemische structuur kwantitatief kan worden gecorreleerd aan een specifieke werkwijze wordt QSAR vaak gebruikt voor het ontwerpen van geneesmiddelen en drugs. Deze methode wordt gebruikt om chemische synthese te begeleiden, want er zijn vele duizenden verschillende mogelijke structuren voor een molecuul en wetenschappers anders zou verspillen veel tijd het testen van elke structuur. Statistieken spelen een belangrijke rol in de methodologie van QSAR. Meervoudige lineaire regressie

Multiple lineaire regressie-analyse
wordt gebruikt wanneer er meerdere studies gebruikt die gerelateerd zijn aan een specifieke chemische structuur. Een vergelijking ontwikkeld dat bijvoorbeeld kan een relatie tussen tumorgrootte verminderen en de aanwezigheid van een hydrofobe groep op de vierde positie van een fenylring tonen. Deze analyse vermindert veel verschillende verbindingen, zodat de correlatie kan worden geïnterpreteerd met behulp van slechts een paar parameters die zijn het belangrijkste.
Pattern Recognition

Patroonherkennen
wordt gebruikt om parameters te definiëren die ontstaan ​​wanneer specifieke chemische structuren elkaar staan. Er zijn verschillende soorten van patroonherkenningsanalyse, die hoofdcomponent Analysis, computer geautomatiseerde structuur evalueren en geautomatiseerde data-analyse door patroonherkenningstechnieken omvatten. Patroon statistieken erkenning gebruiken oorspronkelijke gegevens en zal correleren de verschillende structuren met de biologische resultaten op basis van verschillende afmetingen, met de meest significante wezen in de eerste berekende component.
Comparative Molecular Field Analyse

Deze versie van QSAR
neemt partiële kleinste kwadraten analyse gecombineerd met cross validatie aan voorspellingen voor de biologische activiteit te creëren. In dit soort methodologie, zal de wetenschapper specifieke regels voor de aanpassing van de moleculaire structuur toewijzen. Elk van de moleculen passen in een raster en verschillende interacties worden berekend op basis van interactie van een probe atoom tot verschillende rasters. Er zijn veel verschillende vergelijkingen die kan leiden. In tegenstelling tot andere type regressie Dit produceert vergelijkingen waarin veel meer parameters dan mogelijke verbindingen
Apex -. 3D

Apex-3D gebruikt een systeem die automatisch de beste uitlijning en bevestiging van de structuren afhankelijk van wat biologische respons uit eerdere experimenten. Het is mogelijk om het effect van verschillende bindrichting, antagonistische activiteit versus agonistische activiteit en effect van verschillende receptoren onthullen. Dit genereert 2D-en 3D-topografische matrices en kan informatie voor paren van moleculen in plaats van enkele moleculen te genereren.
Genetische Functie Harmonisatie

Genetische functiebenaderingen
wordt gebruikt wanneer er weinig monsters en verschillende variabelen onderzocht, en wanneer de datasets niet lineaire relaties. Deze maakt gebruik van best-rated modellen en worst-rated modellen berekend op basis van de ruwe data. Het bouwt een betere en betere kwaliteit modellen door het vervangen van de ergste-rated modellen. De vele verschillende meervoudige fits worden vervolgens verstrekt aan de wetenschapper, die vervolgens selecteert het uiteindelijke model. De overeenkomsten tussen de modellen worden bestudeerd om informatie te verstrekken over de structurele en biologische correlaties.