Hoewel de meeste bacteriën onschadelijk of nuttig zijn, veroorzaken pathogene stammen ziekten op verschillende manieren:

1. Voedselvergiftiging: E. coli (rundvlees, rauwe groenten), Salmonella (kip, eieren) na onvoldoende verhitten/wassen.
2. Wondinfecties: Clostridium perfringens (gasbrand), Staphylococcus aureus (MRSA) → sepsis, amputatie, dood.
3. Overige infecties: Helicobacter pylori (maagzweren), longontsteking, SOA's (bijv. chlamydia, gonorroe).
4. Wateroverdraagbare ziekten: Onbehandeld water bevat bacteriën die diarree, braken, maagkrampen geven.
5. Plantenziektes: Bacteriële pathogenen vernielen gewassen → voedseltekorten, economische schade.

Hygiëne, veilig voedsel, schoon water en gewasbescherming zijn essentieel om risico's te minimaliseren.